《招标投标法》和《政府采购法》的适用范围在一定程度上存在不协调的问题。《招标投标法》适用于在我国进行的招标投标活动。《政府采购法》的适用范围涉及采购单位（国家机关、事业单位和团体组织）、采购资金（财政性资金）和采购对象（货物、工程和服务），只有三方面都符合法律的规定，才纳入政府采购法的调整范围。
由于《招标投标法》制定在前，工程招投标已由《招标投标法》进行规范，《政府采购法》规定：“政府采购工程进行招标投标的，适用招标投标法”。2012年实施的《招标投标法实施条例》和2015年实施的《政府采购法实施条例》对采用招标方式采购的政府采购工程的法律适用作了衔接，规定政府采购工程以及与工程建设有关的货物、服务，采用招标方式采购的，适用招标投标法律制度，采用其他方式采购的，适用政府采购法律制度。
通过两法实施条例在制度上的衔接，在一定程度上厘清了两法的“楚河汉界”。但在实践中，由于相关部门和采购单位对两法的理解存在差异，导致法律适用问题上仍存在一定的障碍。